Японская морская авиация, базировавшаяся как на берегу, так и на авианосцах, была тесно связана со структурой японского Императорского морского флота.

Возглавляло всю эту организацию Министерство военно-морского флота Япо¬нии, которому формально подчинялся штаб Объединенного флота (Ренго Кантай). До апреля 1943 года возглавлял штаб адмирал Ямамото.

Объединенный флот состоял из нескольких флотов (кантай), каждый из кото¬рых контролировал свой участок Тихого или Индийского океана. Среди этих флотов имелся Воздушный Флот (Коку Кантай).

Воздушный Флот, в свою очередь, подразделялся на воздушные флотилии (Коку Сентай), флотилии состояли из воздушных групп (Кокутай). Кокутаи счита¬лись основной организационной структурой Воздушного Флота.

Воздушные группы (корпуса) по численности соответствовали авиационному полку (крылу) европейских стран. Численность групп зависела от типа группы (истребительная, бомбардировочная или смешанная группа) и насчитывала до 84 са¬молетов и до 2000 человек личного состава. Иногда размеры кокутая могли превы¬шать названную численность. В свою очередь, кокутай состоял из пятнадцати секций (бунтай). Например, кокутай бомбардировщиков подразделялся на четыре авиацион¬ные секции (хикобунтай), четыре секции обслуживания и секции интендантства, связи, метеорологического оповещения, медицинскую и материально-техническую секцию.

Как правило, кокутаем командовал офицер в ранге тайса (капитан 1-го ран-га/полковник). Этот офицер имел заместителя, отвечающего за выполнение приказов и офицера, командующего самолетами во время выполнения боевого задания. Замес¬тители носили погоны тай-и (капитан-лейтенант/капитан) или, реже, сёса (капитан 3-го ранга/майор).

Каждому кокутаю был присвоен идентификационный номер или собственное имя. Например, к середине 1944 года было 85-90 кокутаев. Из них 65 имело номера, а остальные носили имена баз, где проходили формирование. Около 40-45 кокутаев бы¬ло развернуто в воздушные флотилии, а остальные кокутаи базировались на авианос¬цах или других надводных кораблях.